Existen virus que ocultan los archivos y carpetas de nuestra memoria USB, entre ellos el más conocido es Recyler, si en algún momento te sucede este problema ten en cuenta las siguientes opciones para dar solución inmediata a esta cuestión:
Mediante programas
USB Show es una herramienta de 108 Kb que hace precisamente esto mostrar/des ocultar todo archivo y/o carpeta de una memoria USB, no necesita de instalación y es de simple uso.
Mediante trucos
Previamente debemos fijarnos en Mi PC la letra de unidad de la memoria USB, supongamos que es F, luego nos dirigimos a Inicio > Ejecutar (Windows+R) y escribimos cmd.
En la siguiente ventana colocaremos el siguiente texto:
attrib -s -h -r f:/*.* /s /d
Ojo que la letra f es la asignada en este ejemplo, si en tu caso fuera distinta solamente tendrás que cambiarla.
Finalmente pulsamos Enter y veremos que en nuestra memoria USB aparecerá todo lo que antes estaba oculto.